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佛山sequenom甲基化检测

佛山sequenom甲基化检测

  • 所属分类:佛山分子及免疫实验服务
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  • 发布时间:2022-02-15 14:53:41
  • 产品概述

产品介绍:

将待测DNA经过亚硫酸盐处理,通过PCR扩增过程引入T7启动子序列,经T7 DNA聚合酶的体外转录过程得到各样本RNA产物,经碱基特异性酶切处理,得到RNA小片段,并用飞行质谱检测每个片段的分子量,EpiTYPER程序完成数据的自动化处理并报告每个检测片段的甲基化程度。

技术优势

·   检测片段长:扩增片段长度可达500bp

·   高灵敏度:可发现低至5%甲基化水平,样本起始量低至10 ng。

·   重复性好:变异系数CV≤5%。

·   高性价比:用384孔板进行PCR反应,一个扩增产物可以进行多重CpG位点分析,无需后续验证,可直接用于文章发表。

服务内容

1. 根据客户提供的序列信息进行预评估;

2. 进行样本DNA的分离、纯化、质检及亚硫酸盐修饰。

3. 使用特殊设计的一对引物扩增样本,得到带有T7 RNA聚合酶启动子序列的扩增产物。

4. 在体外转录体系中,利用T7 RNA聚合酶,将扩增产物转录为RNA片断。

5. 利用RNase A能够特异性识别并切割RNA中U 3’端的特性,将RNA片断切割成携带有CpG位点的小片断。

6. 使用sequenom®MassArray飞行质谱分析系统检测产物。由于同一片断中,只有CpG和CpA之间16Da的分子量差别,即质谱图中两者峰的差距。


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